日本分子生物学会

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GTC cover art April 2022

April 2022
食べ過ぎにご用心!メチオニンしだれ桜

One Japanese bullfinch (Pyrrhula pyrrhula griseiventris), which likes to eat cherry blossoms, perches on a drooping cherry branch. This cherry tree has particularly well-shaped branches, and if we compare its flowers to five- or six-membered rings and the buds to sulfur atoms, the form of the flowers, buds and branches around the bird resemble the structure of methionine (left) and its metabolites, S-adenosylmethionine (SAM; top) and S-adenosylhomocysteine (SAH; right). It has been reported that restricting methionine intake extends lifespan in a variety of species. Hopefully this bullfinch doesn't eat too many flowers.
桜の花を好んで食べる鷽(ウソ)(Pyrrhula pyrrhula griseiventris)が一羽、しだれ桜の枝に止まっている。この桜は特に枝の形がよく、花を五員環あるいは六員環に、つぼみを硫黄原子にそれぞれ見立てると、鳥の周りの花、つぼみと枝の形がメチオニン(左)とその代謝物であるS-アデノシルメチオニン(SAM; 上)、S-アデノシルホモシステイン(SAH; 右)の構造に似ている。さまざまな生物種で、メチオニン摂取を制限すると寿命が延長するという報告がある。この鷽も花を食べ過ぎなければよいのだが。

GTC cover art March 2022

March 2022
Hi-C菱餅

The Hi-C method (a method to examine genomic regions that are close to each other in the nucleus by fragmenting and ligating cross-linked nuclear chromatin and then reading the paired-end sequences by NGS) has revealed the existence of structural units called topologically associating domains (TADs) that are separated by insulators in the genome. When the results of the Hi-C method are drawn as a heatmap, TADs appear as characteristic diamond-shaped signals, with deeper colors indicating the higher probability that regions of the genome are closer to each other. We drew them on Hishimochi rice cakes (diamond-shaped rice cakes), an essential decoration for the Japanese Doll's Festival on March 3. We thank Drs. Ichiro Hiratani and Hisashi Miura (RIKEN BDR) for providing the data.
Hi-C法(クロスリンクした核クロマチンを断片化・リガーゼ処理し、NGSでペアエンドの塩基配列を読むことで、核内で互いに近接しているゲノム領域を調べる方法)により、ゲノムにはインシュレーターにより隔てられたtopologically associating domain(TAD)という構造単位が存在することが明らかとなってきた。Hi-C法で得た結果を、ゲノム上の領域どうしが互いに近接している確率が高いほど色が濃くなるヒートマップとして描くと、TADが特徴的なダイヤモンド型のシグナルとして浮かび上がる。それを、日本の3月3日の桃の節句の飾り付けに欠かせない菱餅の上に描いてみた。データを提供していただいた平谷伊智朗博士と三浦尚博士(理研BDR)に感謝申し上げる。